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一、这条流程在解决什么问题 这次要处理的是三批猪 Hi-C 数据：6month、70day、9year。手头已经有去重后的 validPairs，目标是把它们整理成 FitHiC2 能吃的 10 kb 输入，再跑出显著互作。 ...

中转 API 站点内卷和信息茧房的现状 最近看了一圈 AI 中转 API 站点，最大的感受不是“这行真赚钱”，而是“这行真魔幻”。 同样是接 OpenAI、Claude、Gemini、各种国产模型，站点之间的价格可以差到离谱。低的低到像是在清库存，高的又高到让人怀疑是不是有人根本不知道官方价格长什么样。最有意思的是，便宜的站点未必没人用，贵的站点也照样有人买单。 ...

EYKTHYR：从空间多组学中寻找驱动基因程序的转录因子 1. 文章信息 原文：EYKTHYR reveals transcriptional regulators of spatial gene programs DOI：10.1101/2025.05.19.654884 PubMed：PMID 40475415 代码：gkrieg/eykthyr 作者：Spencer Krieger, Ellie Haber, Jian Ma 机构：Carnegie Mellon University 类型：bioRxiv 预印本，尚未同行评议 版本日期：2025-05-23 这篇文章提出的 EYKTHYR 是一个面向空间多组学的转录因子调控推断框架。它把空间转录组、空间染色质可及性和细胞空间邻域放到同一个可解释模型里，通过模拟 in silico TF knockout 来判断哪些转录因子可能驱动了特定空间基因程序。 ...

这篇主要记一个很容易误判的问题：mamba activate 之后，top、find 这类系统命令突然“消失”了。 一开始很容易怀疑是系统没装这些命令，但只要对比激活前后，就会发现真正的问题其实是 PATH 被改坏了。 ...

0、默认 本教程默认你已经成功实现Windows的，右键新建一个Markdown file的功能，可见教程。 且你使用的Typora中，图片存放位置为./images/${filename}，否则需要略作修改，若全部看懂完全可以自行操作或联系作者。 1 使用前先看 1.1 先改一个路径 如果你要使用文末“可选：右键在 Obsidian 中新建笔记”的注册表代码，请先把所有代码里的 Obsidian 安装路径替换成你自己的实际路径。 ...

LiMCA：单细胞三维基因组与基因表达联合测量揭示嗅觉受体选择背后的动态增强子连接 1. 文章信息 标题： Simultaneous single-cell three-dimensional genome and gene expression profiling uncovers dynamic enhancer connectivity underlying olfactory receptor choice 中文题目可写为： 单细胞三维基因组与基因表达联合测量揭示嗅觉受体选择背后的动态增强子连接 作者： Honggui Wu, Jiankun Zhang, Fanchong Jian, Jinxin Phaedo Chen, Yinghui Zheng, Longzhi Tan, X. Sunney Xie 年份： 2024 期刊： Nature Methods 21: 974-982 DOI / 链接： https://doi.org/10.1038/s41592-024-02239-0 本地 PDF： /root/.openclaw/workspace/skills/bioinfo-singlecell/reports/article-explainers/pdf/simultaneous-single-cell-3d-genome-gene-expression-olfactory-receptor-choice.pdf 2. 一句话总述 这篇文章最重要的贡献，是提出了高灵敏度单细胞联合测量方法 LiMCA，并用它证明嗅觉受体基因的“单神经元只选一个受体”过程，并不是一次性完成的，而是伴随增强子可及性和三维连接逐步重排的分阶段竞争过程。 ...

0、一些链接 重要 文档手册：JavaScript 和 HTML DOM 参考手册 | 菜鸟教程 廖雪峰（本笔记来源）：廖雪峰 JavaScript教程 ...

阅读说明：本文已按层级加入编号，格式为「一级标题：1、标题」「二级标题：1.1 标题」「三级标题：1.1.1 标题」，方便快速定位章节。 1、问题现象 这次故障的表象很简单：在 WSL 里执行 openclaw tui，本地网关已经连上，模型也选到了 custom-api-vibelearning-top/gpt-5.4，但一发消息就直接报： ...

0、一些链接 重要 文档手册：JavaScript 和 HTML DOM 参考手册 | 菜鸟教程 廖雪峰（本笔记来源）：廖雪峰 JavaScript教程 ...

🚀 使用 CC Switch 配置共享 API Key 完整指南 重要 这只是针对于vibe-coding供应商提供的codex API使用的教程，其他更加官方的站点如ClaudeCode、OpenAI-codex这些，教程更多，此处就不讲了。 ...