HiRES单细胞三维基因组与转录组同步解析
📌 ① HiRES — Science, 2023 https://www.science.org/doi/10.1126/science.adg3797 Liu Z, Chen Y, Xia Q, et al. “Linking genome structures to functions by simultaneous single-cell Hi-C and RNA-seq.” *Science* 380, 1070–1076 (2023) 亮点: 这是首篇真正实现单细胞水平同时测量染色质三维构象和基因表达的方法论文。作者开发了 HiRES(Hi-C and RNA-seq Employed Simultaneously)技术,并应用于数千个小鼠发育胚胎单细胞。研究发现,三维基因组结构在高度受细胞周期影响的同时,会随发育进程以细胞类型特异性方式逐渐分化。通过比较染色质互作与转录的拟时序动态,他们发现了广泛的"染色质重塑先于转录激活"现象,证明特异性染色质互作与谱系分化过程中的转录调控密切相关。 ...