📌 ② LiMCA — Nature Methods, 2024

Wu H, Zhang J, Jian F, et al. “Simultaneous single-cell three-dimensional genome and gene expression profiling uncovers dynamic enhancer connectivity underlying olfactory receptor choice.” Nat Methods 21, 974–982 (2024)

https://www.nature.com/articles/s41592-024-02239-0

亮点： LiMCA（Linking mRNA to Chromatin Architecture）通过物理分离同一细胞的细胞质（mRNA）和细胞核（染色质），实现了对 3D 基因组结构和转录组的高灵敏度联合检测。研究者将 LiMCA 与他们开发的高分辨率 scATAC-seq 方法（METATAC）结合，成功解析了单个嗅觉感觉神经元发育过程中的染色质可及性、3D 基因组结构和基因表达信息，扩展了已知的嗅觉受体增强子库，揭示了“一个神经元—一个受体”选择过程背后动态的空间调控规律。

  • 组学组合：scHi-C + scRNA-seq + scATAC-seq（三组学联合）
  • 创新性：灵敏度极高；三组学同细胞联合揭示增强子调控新规则
  • 期刊：Nature Methods（方法学顶刊）